myBaits Expert UCE 超保守元件捕获探针
myBaits Expert UCE 超保守元件捕获探针
超保守元件(UCEs)是高度保守的基因组区域,在其侧翼有很多可变序列。因为许多基因组区域在大的分类范围内共享,在新物种和非模式物种的研究方面,这些关键区域作为系统发育的理想目标捕获候选区域已被定义和开发。Arbor Biosciences 为各种分类学类群提供一系列即用型UCE探针,包括脊椎动物、昆虫和植物中鉴定出的类似的保守直系同源基因(COS)位点。
产品特点
预设计 ——由专家设计,可立即使用
结果经验证——不断扩大的经同行评审的论文清单
流水线分析——简单、方便的数据分析
完整的解决方案——试剂盒包括所有必要的试剂
应用范围广——具有适用性高的通用Panels
BLAST 鸡、人类、老鼠和青蛙基因组中,脊椎动物5K UCE基因位点的比对。每个碱基的颜色是由相似度决定的(深=高,浅=低)。中部UCE区域的相似度,明显不同于与其直接相邻的基因组侧翼的相似度。
产品应用
系统发生学
群体遗传学
生命之树
侧翼区捕获
即用型PANELS
脊椎动物
辐鳍鱼类 0.5Kv1
鲈形目1Kv1
骨鳔类2.7Kv1
脊椎动物2.5Kv1、5Kv1和5Kv2B
无脊椎动物
蛛形纲1.1Kv1
蜘蛛2Kv1
鞘翅目1.1Kv1
双翅目2.7Kv1
半翅目2.7Kv1
膜翅目1.5Kv1、2.5Kv2P、2.5Kv2A和2.5Kv2AB
鳞翅目1.3Kv1
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其他物种UCE可定制,详情请联系我们。 现有定制案例:两栖类、珊瑚等。文献引用
J. Starrett et al. (2017). High phylogenetic utility of an ultraconserved element probe set designed for Arachnida. Molecular Ecology Resources
J.E. McCormack et al. (2016). Sequence capture of ultraconserved elements from bird museum specimens. Molecular Ecology Resources
B.C. Faircloth et al. (2015). Target enrichment of ultraconserved elements from arthropods provides a genomic perspective on relationships among Hymenoptera. Molecular Ecology Resources
B.C. Faircloth et al. (2012). Ultraconserved Elements Anchor Thousands of Genetic Markers Spanning Multiple Evolutionary Timescales. Systematic Biology